Rillenputz
Rillenputz ist ein kostenloses Programm, das noch immer gute 'Dienste leistet. Hier heißt es oft ausprobieren, welche Einstellungen richtig sind, dann bekommt man aber auch hervorragende Ergebnisse. Oft ist die Abwägung, wieviel Störungen weggenommen werden sollen und was drin bleibt, Geschmackssache.
http://www.heise.de/ct/ftp/05/03/138/
Laden Sie die Datei 0503-138.zip herunter und folgen Sie der Anleitung.
Audacity
Eine freie Software zum Bearbeiten von Audio-Dateien. Audacity bietet viele Filter wie Kompressoren, anpassen der Lautstärke, Klangfilter usw. an, und ist auch für Projekte mit vielen Audio-Spuren eine gute Wahl.
Die Seite ist englisch, man kann sich aber gut zurecht finden.